alep ha scritto:grazie sky, ma non riesco a capire molto bene il discorso della comparazione del genoma.....
Quindi se i ceppi sonoi uguali la possibilità è 50/50, o mi sbaglio?
Non mi sono azzardato a calcolare le probabilità nel caso che fossero uguali per dimostrare che é stato proprio lui. Suppongo piuttosto una probabilità del 90%,95%,99%, senza raggiungere i 100% causa l'altissima velocità di mutazione, per cui i due ceppi possono divergere (ma poco, giusto in qualche parte nella loro sequenza genomica) in pochissimo tempo:
http://cid.oxfordjournals.org/content/56/11/1667.full
Da cui:
It is estimated that up to 5 mutations may arise with each replication cycle. The daily production of more than a billion new virions in a typical chronically infected patient implies that the virus undergoes 10–100 million rounds of replication daily, resulting in the rapid generation of viral progeny carrying every possible mutation throughout
Prima facevo osservare solo che ci sono in giro cosi tante migliaia di ceppi virali, simili ma non perfettamente uguali, che confrontando il genoma (DNA) é possibile vedere con una alta probabilità se uno si é infettato proprio da un'altra persona, o viceversa. Sopratutto il viceversa, cioè dimostrare il NON contagio quando i due ceppi divergono significativamente: se uno si trova un HIV-1 group M subtype A e l'altro un HIV-1 group M subtype B, su può supporre con probabilità quasi assoluta che il primo non l'abbia trasmesso al secondo.
Ma dopo i gruppi e i subtipi, le sigle dei ceppi virali continuano. Questa é un'altra rappresentazione grafica di tutte le mutazioni finora censite, raggruppate per "similarità", ovvero per le parti in comune della loro sequenza genomica (le mutazioni possono avvenire in regioni differenti nella lunga catena del DNA):
I due ceppi virali, del donatore e del ricevente, anche se iniziano ad evolvere indipendentemente fin dal giorno stesso del contagio, non possono differire eccessivamente in troppe parti differenti nelle loro sequenze di DNA, nel giro di troppo poco tempo. Per avere differenze consistenti occorrono anni, o una "pressione genetica", ma qui il discorso si fa lungo.